ingreso sin factura fiscal

Mi clienta Recibe los pagos a través de una compañía de adquiriencias ellos nos retienen el 2% por ser ese tipo de compañia pagos con tarjeta de credito , Uepa Pay nos paga a nosotros via transferencia, como comprendera tengo un itbis por pagar, de qué manera lo hago sino tengo una factura  

Si el ingreso es para mi clienta y para yo como su contable como procedo a pagar ese itbis , con que comprobante ya que no tenemos factura